為保護產品不受外界污染，或為了有助于在兩室間實現較高壓差，可在需要嚴格控制壓差的房間出入口設緩沖室。
1、僅為了防止縫隙滲透，所需靜壓差理論值極小：美國ASHRAE手冊給出0.25Pa，我國學者計算出0.22Pa。美國醫院標準包括手術室和隔離病房實際推薦的是2.5Pa。
通過實驗得出壓差和進出房間時污染泄露的關系，如下圖：

可以看出，負壓從0Pa增至-6Pa，泄露多減少41%，從0Pa至-30Pa，減少62%。
通過藥品添加劑實驗，壓差和粉塵侵透的關系，如下圖：

可以看出，負壓從0Pa增至-6Pa，微粒傳播量多減少41%，從0Pa至-30Pa，減少60%。
2、只靠室內外壓差是不能杜絕污染傳播的，其中原因之一是門的開啟。門一開壓差即消失。如下圖：

3、根據理論和實驗，一道緩沖室可減少污染傳播近40倍，兩道緩沖室可減少2000余倍。
（1）可在室門外設單側正壓緩沖室，即緩沖室對室內為負壓，對室外為正壓。可參考下圖的設置：
這種緩沖室應有不小于6立方米的體積，具有和進入室同樣的潔凈度（可不高于6級，換氣次數按要求潔凈度確定），兩邊的門不要同時開啟。
（2）為保護無菌生物制品不污染外界自身又不受污染，可參考下面三圖設緩沖室：

   
   
這種緩沖室除應有不小于6立方米體積和雙門不同時開啟要求外，應有潔凈送風，換氣次數不應低于60次/小時。
為了實現污染區氣流不外溢，半污染區以內的氣流也不外流到清潔區和室外，可用下圖所示的單側正壓緩沖室。

此圖中室外空氣可長驅直入，對產品不能保護。為改變這種傾向，可改用下圖所示的在清潔區再設雙側正壓緩沖。

（3）為了加強隔離，也可做兩間雙側一正一負緩沖，如下圖：

（4）為了既需要將產品隔離，同時又需要高的空氣質量以保護產品，可用下圖所示的入口處設一負一正兩級緩沖室。

（5）上圖有來自半污染區以內的外向氣流，為消除這一現象，還應把正壓緩沖室放于清潔區，如下圖：

4、緩沖室有助于實現高壓差
（1）按現行GMP要求，不同潔凈度級別房間之間要有不小于10Pa的壓差。前面介紹的國內外實驗和理論研究都證明高壓差并無必要，如美國關于手術室、負壓隔離病房的標準，規定壓差只要2.5Pa。但GMP既已規定，執行起來不僅達到難，而且能耗是很大的。
（2）在兩室之間設一緩沖室，能容易實現10Pa壓差，耗能又少，如下圖：

如7、8級兩級房間都很大，或縫隙很多，實現7級對8級10Pa正壓要很大的新風量，而且不容易達到。
如果在兩室之間或如上圖在8級間加一個小門斗，只送風，并在至8級的門下開一百葉，則只要很少送風量即能使緩沖室對8級間達到10Pa。由于7級間與緩沖間是同級，沒有壓差要求，只需有很小正壓差維持定向流即可。
由于緩沖室很小，又是空房間，實現7級潔凈度的換氣次數很小，風量很小。