當送風口、回風口布置好后，可進行送風管、回風管的布置。在凈化空調風管系統中，由于高效送風口的高度在500～600mm，所以送風管和回風管即使發生交叉也很容易布置。一般情況下送風管在上方，回風管在下方。對于采用主流區送風的手術室，高效送風天花一般為側進風。所以，在吊頂夾層內送風支管可設置在回風支管的下面。風管尺寸可根據風量與推薦風速來確定。風管內風速應根據室內容許噪聲級要求，按下列規定選用。
總風管風速為6～10m/s，取用小風速，產生的噪聲小，所需的風管斷面尺寸大，占用的空間也大，初投資大；取用大風速，產生的噪聲大，風管斷面尺寸可減小，占用的空間也小，建筑層高可降低，初投資較小。所以在選用風速時既要統籌兼顧，還應主次分明。一般總風管風速小于8m/s為好，若由于空間尺寸的原因，總風管內風速大于8m/s時，應把消聲器裝在風速較小的主支風管上。
支風管風速：無送、回風口的支風管取4～6m/s；有送、回風口的支風管取2～5m/s。
根據上述規定，選用適當的風速計算出風管斷面面積后，應考慮鍍鋅鋼板的模數、風管加工工藝、安裝空間、是否穿墻等因素，并參考規范推薦的矩形風管規格來確定風管的斷面尺寸。凈化空調風管要求拼接縫盡可能少，所以，盡可能利用鍍鋅鋼板的尺寸模數，減少拼接縫。風管的單節長度盡量不大于2m，風管的連接方式宜采用法蘭連接，保證密封性可靠。
1、送風管的布置方法
送風口位置、風管尺寸確定后，開始布置送風管。先用單線畫出各送風支管的走向，主風管的位置。根據各支管的風量、主風管的位置、空間尺寸，反復調整，使氣流分配均衡、順暢為準。在凈化空調系統中，當風管在水平面方向縮小尺寸時，盡可能不專門設置變徑管，應利用三通、四通或彎頭進行變徑。因為增設變徑管，使得連接法蘭增多，浪費材料且漏風量增加。當風管在高度方向變小時，應采用變徑管，不應在三通、四通等管件處變徑。否則容易漏風。在高度方向變徑時，應保持風管下表面平直，上表面斜向下變徑，便于風管的安裝。在每臺高效過濾器送風口入口處，均應設置密閉調節閥，以便于系統風量的調節。
當計算出的高效送風口進風支管尺寸比其接口小時，宜選用接口尺寸。例如1000m³/h風量的高效送風口，其進風接口尺寸為320*200mm，當計算出的尺寸比它小時，還需設置變徑管（切忌用軟接頭變徑），這樣便于取用接口尺寸，安裝方便還可減小送風速度。
2、回風管的布置方法
回風管的布置方法類同送風管，與回風口相連接的回風支管上應裝設調節閥，應注意回風口與支管的連接形式。夾道回風的形式因為施工安裝方便得到廣泛應用。若采用回風支管直接與回風口連接的形式，由于回風口長寬比比較大，所以，回風口與支管之間宜采用靜壓箱相連接。這種形式在安裝時需交叉施工，很不方便。
送回風主管及主支管的布置應視具體情況而定，當工程為改造工程時，這些管道的布置應以在土建墻上少開大洞為好，即管道穿墻的大洞越少越好。若為新建工程，安裝空間不受限制時，這些管道的布置以順暢、初投資少為好。
送回風主管上均應安裝調節閥，其安裝位置盡量在組合式凈化空調機組的出風口及回風口處。各支管處閥門安裝的原則：在主支管分叉處宜安裝閥門，以便初調節時用；在各潔凈室所有送風口的連接支管及回風支管均應安裝調節閥，以便調節風量及壓差；除此之外的其它分支管，視阻力平衡情況酌情裝設調節閥。
如果需要裝設消聲器，應選用微穿孔板消聲器，且應裝設在送風管和回風管上。對于送風管上的消聲器，其后的管內風速應不大于其前面的管內風速；對于回風管上的消聲器，其前面的管內風速應不大于其后面的管內風速，以保證消聲效果。